CRSに配慮してください。

【特にQGISのバージョン間での問題】

QGIS 4.xとQGIS 3.xではファイル構造が大きく変更になったようで、一部のデータが飛びます。
特にCRSは設定しなおす必要があるようです。

DEMデータを使う上で、標高の数値、すなわちZ座標を扱う場合はDEMデータは直交座標系でなければなりません。
そうでなければうまく断面図などが描けません。
ドレープでラスタ値からZに値を与える際も失敗します。
要するにXYZの直交座標系である必要を忘れないでください。

QGIS 4.xになってからはCRSの設定が知らず失われてしまい、なぜ断面が描けないのか気づくのにかかったことがあります。